為有效管控各事業產生之事業廢棄物，確實依環保法令規定，進行清除、處理或再利用，並定期以網路傳輸方式完成申報，且於規定期限內上網查詢與確認事業廢棄物之清除、處理及再利用情形，以避免違規受罰，制定有「事業廢棄物上網申報及追蹤管理作業要點」，執行廢棄物之分類、收集、儲存、管理、清運，以有效管制廢棄物。做好源頭減量管制，實施製程減廢措施，並做好污染防治及環境監控工作，充分利用處理合格後之廢水送回製程循環使用，或將處理後合乎排放標準之廢水，引灌農場再利用。
畜殖事業部於大響營第一、二畜殖場、六塊厝、海埔、四林畜殖場興建廢水沼氣發電設備，有效降低畜殖場周界異味，且能資源循環再利用，對環境品質改善大有幫助。2017年廢棄物資源化比例達88.72%較2016年增加0.8%，為2017年廢棄物總量減少，並降低無資源化廢棄物如飛灰穩定化物、廢一般物品容器、廢液產生量，形成資源化比例上升，顯示我們努力達到廢棄物資源化、安定化、無害化、經濟化的決心。
畜殖事業部於大響營第一、二畜殖場、六塊厝、海埔、四林畜殖場興建廢水沼氣發電設備，有效降低畜殖場周界異味，且能資源循環再利用，對環境品質改善大有幫助。2017年廢棄物資源化比例達88.72%較2016年增加0.8%，為2017年廢棄物總量減少，並降低無資源化廢棄物如飛灰穩定化物、廢一般物品容器、廢液產生量，形成資源化比例上升，顯示我們努力達到廢棄物資源化、安定化、無害化、經濟化的決心。
