由於環保法規日益嚴格，以及燃燒重油對環境的影響，為降低小港精煉糖廠的碳排量，本公司於2017年與臺灣中油公司完成天然氣採購議價簽約，惟鄰近地區里長受2014年7月31日高雄氣爆事件影響，對天然氣管線埋設工程頗多疑慮，因此持反對立場。為此，台糖公司除了進行燃油及備用鍋爐改燒天然氣設置工程，並拜訪小港區長及5位里長及召開協調會，積極與附近鄰里及民代溝通，經歷多次溝通、會勘、試挖等作業，終於2020年6月順利發包廠外供氣管線工程，並於2021年6月獲准以水平導向鑽掘施工(Horizontal　DirectionalDrilling,HDD)，開始進行廠外管線埋設工程。2022年1月，廠內、外天然氣管線完成，進行鍋爐操作許可證更，3月14日正式改燃天然氣。改燃天然氣至今已近1年，未有任何使用天然氣所造成之公共安全問題，鄰近地區鄰里亦未再提出異議。

        台糖公司為國內開創企業化養豬之先驅，自1952年開辦畜牧養殖事業以來，迄今已有70餘年之久，在國內建立了現代化企業經營模式，但因舊有畜舍以傳統磚造為主，用牆群及圍欄做區隔為開放式畜舍，雖然通風良好，但由於豬糞尿以傳統方式處理，對鄰近居民生活產生不良的視覺、聽覺、嗅覺衝擊，從而影響生活上的味覺和觸覺感知，陳抗事件及衛生局裁罰不斷，也使得豬場成為鄰避設施。

        為徹底解決養豬的環保問題，台糖先於2016年啟動「東海豐負壓水簾及綠能設計豬場改建計畫」，經行政院農委會、經濟部支持及透過行政院會決議，2018年再推行13座養豬場的「農業循環豬場改建投資計畫」，全面加速推動畜殖場現代化，透過畜殖場改建加強檢控場內廢水及廢棄物處理流程，並持續針對W作業流程進行檢討改善，將豬場內之豬糞尿收集後分為四個路徑處理：

1. 生質能：經由發酵產生沼氣用於發電，增加發電收入(綠能電資源)。
2. 沼渣堆肥：經過固液分離後將沼渣翻堆腐熟後做成堆肥，友善鄰里並增加肥料收入。
3. 沼液回收：經污水處理後之沼液部份回收場內再利用(水資源)，將異味控制至容許範圍內，可以被接受且符合法令規範，兼顧豬場配置及產能、生物防疫、妥善處理污水及臭味，並翻轉民眾舊有刻板觀念，能逐漸認同畜殖循環綠能產業。
4. 沼液沼渣還肥於田：配合環保署推行沼液沼渣農地肥分使用及農業事業廢棄物個案再利用，將沼液沼渣回歸農田增加土壤肥力，降低廢水排放河川，減少污染。

        台糖公司共有17座畜殖場，皆採用二級廢水處理系統，均依水污法規定每半年委由合格檢測機構採樣分析(廢水排放標準：生化需氧量(BOD)80mg/L、化學需氧量(COD)600mg/L、懸浮固體(SS)150mg/L)，並於環保署指定網站線上填列畜牧業廢(污)水檢測申報表，採網路傳輸方式辦理定檢申報。台糖期待未來畜殖場改建後為臺灣畜殖產業帶來轉型契機，使其能兼顧生產及環境永續，給予周遭居民視野清新、公園綠化、空氣無味、降低居民生活與心理層面不滿的新五感體驗，未來若有機會將開放豬舍外圍綠帶供居民使用，從而與居民達到真正的和諧共融。

        由於生質能發電所使用的是豬糞尿經厭氧發酵後產生沼氣能源，並經過脫硫處理後用作發電，此舉能將原先存在於豬糞尿所產生的甲烷等溫室氣體，將其轉換成能源，避免這些溫室氣體逸散至大氣進一步加劇全球暖化，而發酵完後的沼液及沼渣更可被當作肥料，回歸農田供農作物生長而不會造成污染或浪費。

        畜殖事業部2022年已執行豬場場內自有廢(污)水回收再利用，16場(外埔、萬興、虎尾、斗六、岸內、南靖、鹿草、海埔、善化、南沙崙、新厝、四林一、四林二、大響一場、大響二場及東海豐)回收再利用量共計631,949公噸。另配合環保署推行沼液沼渣農地肥分使用及農業事業廢棄物個案再利用，將豬場沼渣沼液施灌至台糖自有農地，累計至2022年施灌67,619公噸(南靖、新厝、四林一、四林二、大響一及大響二場)，斗六繁殖場辦理液體廢棄物施灌農地再利用3,239公噸，將沼液沼渣回歸農田增加土壤肥力，降低廢水排放河川，減少污染。

        今後台糖公司在進行養豬事業時，將持續推動節能減碳、發展綠能的相關行動，讓畜牧業不再成為某些人或某些團體口中促進全球氣溫上升、環境惡化的嫌惡產業，並且期待更多人、更多企業及團體加入淨零碳排行列，減緩地球環境惡化的速度，給自己以及下一代留下更好的環境。