台糖公司身為臺灣重要的農業企業，積極利用土地及農業資源，配合國家淨零轉型之自然碳匯關鍵戰略，協助推動森林碳匯 (綠碳) 及土壤碳匯 (黃碳) ，為未來可持續發展提供範本，然實際的專案開發還須建立在具科學依據的測量方法學之上，截至2024年底，我國僅有3項自然碳匯方法學，分別為「造林與植林碳匯專案活動」，及10月剛通過的「加強森林經營碳匯專案」與「竹林經營碳匯專案」。此外，環境部亦於2025年3月審查通過「改進農業土壤管理」方法學，目前尚有多項方法學草案進入審查階段，如「低生長林增匯專案」、「紅樹林植林」及「海草復育」等。

　　臺灣過去因曾面臨農業結構調整及國際競爭的挑戰，當時政府鼓勵農業土地轉型為造林用地，台糖也配合國家政策利用離蔗或生產力不佳之農地積極推動平地造林計畫，截至2024年12月底止，已累計平地造林面積達10,309.08公頃，回應政府對於增強森林覆蓋率及減緩氣候變遷的政策需求。隨著近年自然碳匯相關推動條件陸續到位，本公司參照2024年財政部國有財產署推動宜蘭縣三星鄉及臺東縣池上鄉2案，標租彰化縣二林鎮20.32公頃種蔗地綠帶予企業植林及申請溫室氣體自願減量額度，以增加森林碳匯 (綠碳) 量。

　　在黃碳的部分，既有的蔗田可將製糖過程中的副產品如蔗渣和濾泥回歸田間，提升土壤肥力同時促進土壤中的有機碳儲存，2023年起，更啟動國際黃金標準之「小農種碳」專案。