台南區處地址為『臺南市善化區溪美里310號』，目前與本公司砂糖事業部善化糖廠同址辦公。
台南區處組織設置如下：
(一)行政部門：總務課、人力資源課、會計課、政風課
(二)業務部門：善化資產課、仁德資產課、新營資產課、土地開發課、工程課、綜合經營課、園區鐵道課、農場課。
台南區處各業務部門職掌
- 善化資產課、仁德資產課、新營資產課：土地出租（提供設定地上權、短期出租、基地標租等）及出售業務及規劃作業、土地巡查及維護管理、固定資產之管理、出租、出售。
- 綜合經營課：各停閉區開發規劃、文化資產管理。
- 園區鐵道課：五分車搭乘觀光事業與販賣部管理。
- 土地開發課：合建開發及租賃住宅經營管理。
- 工程課：營繕工程、採購發包及履約管理。
- 農場課：農地租賃及景觀植栽產銷、農場平地造林、有機肥製作與販售。
