2004年台南區處成立和砂糖事業部善化糖廠資源共用,位於同一辦公廠區,轄區共有9座糖廠廠區(新營、永康、麻豆、佳里、仁德、玉井、烏樹林、岸內、善化)外加新營副產、生技處等個11單位,管轄之土地範圍遼闊、人員及資產眾多
2003年仁德糖場廠及新營糖廠關廠,合併入善化糖廠
1998年佳里糖廠結束,由善化糖廠接管
1995年玉井工場停壓,廠區由善化糖廠接管;完成堆肥製造廠,解決蔗渣問題。成立雜作股
1994年麻豆工場停壓,併入佳里糖廠接管
1992年兼併玉井糖廠
1990年兼併永康糖廠及麻豆糖廠,糖廠,永康糖廠停壓,僅留麻豆製糖工場繼續作業
1961年更名為善化糖廠
1950年改隸屬於臺灣糖業公司總爺總廠
1946年改稱臺灣糖業公司第二分公司灣裡糖廠
1945年二戰結束,由臺灣糖業監理委員會第二分會接管
1928年擴建第二工場
1909年由臺灣製糖株式會社承繼,取為「灣裡製糖逤所」(臺灣製糖株式會社灣裡製糖所)
1906年正式開始營運
1904年創辦臺南製糖株式會社