本公司事業橫跨多元領域，隨著資訊科技持續導入，營運過程涉及大量數據資料、交易資訊及民眾個資。台糖導入並持續資訊安全管理系統驗證多年，於2025年更通過轉版取得最新 CNS27001:2023（ISO27001:2022）資訊安全管理系統驗證，建立並維持制度化且持續精進之資安管理機制，確保資料於公司、供應鏈及數位服務各節點之機密性、完整性與可用性，降低資安事件對生產、信譽及公共責任之衝擊。

台糖公司訂定「台糖公司個人資料保護管理要點」，設有「個人資料保護推動執行小組」，並依據「個人資料保護法」、「個人資料保護法施行細則」及「台糖公司個人資料保護管理要點」，編撰「個人資料保護作業手冊」。

為防止個人資料被竊取、竄改、毀損、滅失或洩漏，2025年5月22日通函各單位依「台糖公司個人資料保護管理要點」7.4.2之規定指定個資檔案安全維護專人，以辦理個資檔案安全之維護；並規定每年各單位定期辦理個人資料檔案盤點作業、依據「個人資料安全稽核檢查表」執行稽核作業及其他個人資料檔案安全維護措施。

另於2025年1月辦理統籌訓練「個人資料檔案安全稽核實務班」，並於2025年2月協助人力資源處、7月協助商品行銷事業部、8月協助秘書處及企劃處辦理委外廠商之實地個資稽核，共計實地稽核4家委外廠商，稽核結果皆符合本公司個資要點相關規定。2025年度本公司無侵犯客戶隱私權及遺失客戶資料之事件發生。