台糖為追求產品更高品質與服務的永續創新，設置研究發展委員會之研究發展業務控管任務組織，設主任委員由總經理兼任，副主任委員設置1-2人、委員19-35人、執行秘書1人及秘書2-3人。主要執行任務為研究發展政策擬定、研究發展經費預算控管執行、研究計畫管理、研發成果運用追蹤檢討等。經由研究發展業務整合會議，可快速解決涉及研發領域之各單位合作與面臨的問題，發揮研發資源跨單位協調綜效，提高研究能量。

　　台糖研究所原為日治時期的「甘蔗試作廠」，成立至今已超過100年，隨著台糖從「單純砂糖產銷事業」轉型為涵蓋多事業部的綜合事業體，台糖研究所也轉為以生物科技、藥用植物研發為主，近年更順應淨零碳排趨勢，積極投入智慧農業、循環經濟等相關研究。

　　為了更專注發展保健食品、機能飲品及美容保養品等項目，本公司於2003年另成立生物科技事業部，設置微生物醱酵、天然物萃取以及產品包裝等設備，在與台糖研究所共同努力下，目前已有10項產品12項保健功能取得健康食品認證，12項原料取得INCI（國際命名化妝品成分）證明，並獲得相關獎章（如：國家品質標章、水產精品獎、生技醫療品質獎、台灣循環經濟獎等）。

　　2025年4月1日起，為使各組分工更貼合整體研究方向，依任務屬性劃分調整組織名稱如下：「農業技術組、製程技術組、應用生化組」共3個技術組，依技術專長編制、透過跨組密切合作執行跨領域及產品開發任務，另增設有「糖業典藏研究應用組」負責盤點、收集文化性資產並製作數位典藏、建構教育課程及文創商品開發，以及負責科技管理服務的「科技管理與資訊組（原減碳暨產業資訊組）」，提供產業資訊、智慧財產管理運用、市場調查及技術轉移等研究相關之服務，同時兼具研究所與公司內外部單位聯繫之窗口。

【研究所五大核心能力】

　　在永續發展與循環經濟的背景下，本公司長期累積之醱酵與萃取技術已扮演著越來越重要的角色，可應用在廢料／副產物轉化與回收再利用、生物降解劑與材料的生產、合成生物學與新產品開發、環境污染治理等領域，有助實現資源的高效利用和減少廢棄物，創造新穎且友善環境的生產模式。

　　台糖研究所做為教育部認可的學術研究單位，不僅是台糖邁向「健康及綠色產業的標竿企業」的強大技術泉源，相關研究成果亦對我國農業轉型、循環經濟發展有著舉足輕重的意義，基於保護國有智慧產權及公司權益的立場，台糖於2009年即導入「台灣智慧財產管理制度」(TIPS)，說明如下：

智慧財產管理計畫

　　尊重他人之智慧財產權，也維護本公司擁有之智慧財產權。在此原則下訂定了「智慧財產權管理要點」內控制度，相關之專利、商標、著作權、品種權與營業秘密等業務即遵照此制度運作，進而發揮其效用，以確保本公司權益。並導入台灣智慧財產管理制度(Taiwan Intellectual Property Management System, TIPS)，每年由研究所代表參加驗證，確認本公司相關制度與執行情形之妥適性。此外，為增進同仁智慧財產權知識及強化營業秘密概念，本公司2024年度亦持續辦理相關之教育訓練課程。

執行情形

　　台糖公司對於智慧財產策略及管理制度及可能遭遇之智財風險與因應措施，已提2024年4月26日第35屆第25次董事會報告。

　　台糖公司導入TIPS制度已16年，藉由落實TIPS制度及管理架構，並遵循其PDCA精神，持續檢討改進。透過TIPS制度之建立，將智慧財產保護觀念落實到公司各單位。